Перезимовка сеянцев обеспечивается разными способами. Растения не достигшие к концу первого года необходимых для пересадки размеров, остаются на том же участке еще на год. Выкопку и пикировку (пересадку) сеянцев проводят при достижении ими соответствующей высоты, очень густом стоянии растений или более высокого качества, то есть лучшего ветвления корней и коренастости растений. Оставляют на второй год (без пересадки) чаще всего сеянцы бересклета, барбариса, ирги, аронии, сирени, шелковицы, слаборослых видов кизильника, калины и большинства хвойных пород.
Иногда может быть целесообразно провести подрезку корней выкопочным плугом на грядке, чтобы выбрать наиболее сильные для перешколки.
Молодые сеянцы особо неморозоустойчивых видов следует высаживать под колпаки или защищать от мороза другими доступными способами. Если же они остаются на посевных грядах, их можно укрыть лапником. Очень хорошей защитой является также насыпка между растениями торфяной крошки, полуперепревшей хвойной или лиственной земли.
Время выкопки сеянцев для разных пород и видов различно. Листопадные породы обычно выкапывают в конце октября, когда начинают опадать листья. Сеянцы некоторых пород очень долго не сбрасывают листву (черемуха поздняя, бузина и другие). Из-за ограниченности периода, в течение которого возможно проведение полевых работ, их приходится выкапывать, не дожидаясь естественного листопада, При хранении листья с таких сеянцев вскоре опадают. К выкопке лоха узколистного следует подходить очень осторожно. Слишком ранняя выкопка может вызвать поражение их серой гнилью.
Магонию с успехом можно пересаживать уже в конце августа, но при условии, что все работы по выкапыванию и посадке следуют неразрывно. В крайнем случае допускается ее